Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85cE9Q6B2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms