Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FancfE9Q5Z5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancfE9Q5Z5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancfE9Q5Z5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancfE9Q5Z5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancfE9Q5Z5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancfE9Q5Z5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FancfE9Q5Z5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FancfE9Q5Z5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FancfE9Q5Z5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FancfE9Q5Z5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FancfE9Q5Z5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FancfE9Q5Z5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FancfE9Q5Z5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FancfE9Q5Z5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms