Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip11E9Q512 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip11E9Q512 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms