Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms