Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpfE9Q3P4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpfE9Q3P4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms