Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms