Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms