Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r238E9Q373 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r238E9Q373 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms