Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms