Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms