Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fndc1E9Q043 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms