Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd1E9PZ26 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd1E9PZ26 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms