Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms