Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4931408C20RikE9PWP9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931408C20RikE9PWP9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms