Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms