Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gcn1E9PVA8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gcn1E9PVA8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gcn1E9PVA8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gcn1E9PVA8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gcn1E9PVA8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gcn1E9PVA8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms