Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms