Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
5430403G16RikD3Z5L4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms