Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms