Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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