Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms