Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms