Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam47eD3YWC7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47eD3YWC7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms