Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptprz1B9EKR1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms