Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cttnbp2B9EJA2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms