Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms