Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia1B2RXQ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms