Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms