Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd34aB2RW11 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd34aB2RW11 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms