Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrt4B2RU40 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt4B2RU40 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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