Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zscan5bB2RTN3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zscan5bB2RTN3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms