Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms