Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrn3B2RS91 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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