Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CadB2RQC6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CadB2RQC6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms