Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf3B2KF05 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms