Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H60cB1B213 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H60cB1B213 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H60cB1B213 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms