Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf25B1AWN9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms