Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NhsB1AV60 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NhsB1AV60 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms