Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtpruB1AUH1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms