Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik3B1AS29 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms