Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr29B1ARI9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms