Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms