Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M5A7VMS3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms