Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms