Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm6880A3KG45 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm6880A3KG45 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms