Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms