Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Samt1A2BED8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Samt1A2BED8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Samt1A2BED8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Samt1A2BED8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Samt1A2BED8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Samt1A2BED8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Samt1A2BED8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms