Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Upf2A2AT37 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms