Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GabreA2AMW3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms