Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc183A2AJB1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc183A2AJB1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms